Pengurus Fakultas Ekonomika dan Bisnis Universitas Gadjah Mada yang pertama adalah Prof. Kertanegara, S.H. dan Prof. Drs. Soenardjo yang masing-masing ditunjuk oleh Pimpinan Universitas Gadjah Mada sebagai Ketua Fakultas dan Sekretaris Fakultas. Pengurus fakultas ini terus berganti, dan secara lengkap, susunan pengurus Fakultas Ekonomika dan Bisnis pada periode-periode berikutnya adalah sebagai berikut:
Dekan
Prof. Kertanegara, S.H.
Sekretaris
Prof. Drs. Soenardjo
Dekan
Prof. Kertanegara, S.H.
Sekretaris
Prof. I. Gondowardoyo, S.H.
Wakil Sekretaris
Drs. P.I. Oey Liang Lee
Dekan
Prof. Kertanegara, S.H.
Sekretaris
Prof. I. Gondowardoyo, S.H.
Wakil Sekretaris
Roekmono Markam, S.H.
Dekan
Prof. Kertanegara, S.H.
Sekretaris
Prof. I. Gondowardoyo, S.H.
Wakil Sekretaris
Drs. R.T. Hindarsah Wiraatmadja
Dekan
Prof. Kertanegara, S.H.
Sekretaris
Prof. I. Gondowardoyo, S.H.
Wakil Sekretaris
Drs. Guntur Sudarsono
Dekan
Prof. Kertanegara, S.H.
Sekretaris
Wiyanto, S.H.
Wakil Sekretaris
Drs. Irawan
Dekan
Soepojo Padmodiputro, M.A.
Pembantu Dekan I
Drs. Soehardi Sigit
Pembantu Dekan II
Drs. Bambang Riyanto
Pembantu Dekan III
Soetatwo Hadiwigeno, M.A.
Dekan
Drs. Bambang Riyanto
Pembantu Dekan I
Drs. Kaswardjono
Pembantu Dekan II
Drs. Gunawan Adisaputro, MBA.
Pembantu Dekan III
Soetatwo Hadiwigeno, M.A.
Dekan
Drs. Sukadji Ranuwihardjo, M.A.
Pembantu Dekan I
Drs. Irawan, MBA.
Pembantu Dekan II
Soedarsono, M.Sc.
Pembantu Dekan III
Harsono, M.Sc.
Dekan
Drs. Sukadji Ranuwihardjo, M.A.
Sekretaris
Drs. Bambang Riyanto
Dekan
Drs. Sukadji Ranuwihardjo, M.A.
Sekretaris
Drs. Bambang Riyanto
Dekan
Drs. Sukadji Ranuwihardjo, M.A.
Sekretaris
Sukanto Reksohadiprodjo, M.Com.
Dekan
Dr. Soetatwo Hadiwigeno, M.A.
Sekretaris
Drs. Kaswardjono
Dekan
Dr. Soetatwo Hadiwigeno, M.A.
Sekretaris
Drs. Kaswardjono
Dekan
Dr. Soetatwo Hadiwigeno, M.A.
Pembantu Dekan I
Dr. Soelistyo, MBA.
Pembantu Dekan II
Drs. Heidjrachman Ranupandojo
Pembantu Dekan III
Drs. Gunawan Adisaputro, MBA.
Dekan
Dr. Sukanto Reksohadiprodjo, M.Com.
Pembantu Dekan I
Dr. Soelistyo, MBA.
Pembantu Dekan II
Drs. Arief Suadi, MBA.
Pembantu Dekan III
Drs. Gunawan Adisaputro, MBA.
Dekan
Dr. Sukanto Reksohadiprodjo, M.Com.
Pembantu Dekan I
Dr. Budiono Sri Handoko, M.A.
Pembantu Dekan II
Drs. Radiosunu, Drs. Slamet Munawir, Akt.
Pembantu Dekan III
Drs. Gunawan Adisaputro, MBA.
Dekan
Dr. Dibyo Prabowo, M.A.
Pembantu Dekan I
Dr. Nopirin, M.A.
Pembantu Dekan II
Drs. R.A. Supriyono, S.U., Akt.
Pembantu Dekan III
Drs. Iswardono Sardjono Permono, M.A.
Dekan
Prof. Dr. Soedijono Reksoprajitno, MBA.
Pembantu Dekan I
Dr. Suad Husnan, MBA.
Pembantu Dekan II
Drs. Ari Sudarman, M.Ec.
Pembantu Dekan III
Drs. Bambang Kustituanto, M.A.
Dekan
Dr. Nopirin, M.A.
Pembantu Dekan I
Dr. Insukindro, M.A.
Pembantu Dekan II
Drs. Harnanto, M.Soc.Sc.
Pembantu Dekan III
Drs. Mohamad Adnan Hadjam, M.A.
Dekan
Prof. Dr. Nopirin, M.A.
Pembantu Dekan I
Dr. A.R. Karseno, M.A.
Pembantu Dekan II
Drs. Harnanto, M.Soc.Sc.
Pembantu Dekan III
Drs. Mohamad Adnan Hadjam, M.A.
Dekan
Prof. Dr. Zaki Baridwan, M.Sc.
Wakil Dekan Bidang Akademik
Prof. Dr. Basu Swastha Dharmestha, MBA.
Wakil Dekan Bidang Administrasi Umum
Drs. Dumairy, M.A.
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan
Drs. Mohamad Adnan Hadjam, M.A.
Dekan
Dr. Ainun Na'im, MBA.
digantikan oleh Dr. Lincolin Arsyad,.M.Sc. (2007)
Wakil Dekan Bidang Akademik
Dr. M. Masykur Wiratmo, MSc.
digantikan oleh Dr. Supriyadi, M.Sc. (2007)
Wakil Dekan Bidang Administrasi Umum
Dr. Didi Achjari, M.Com.
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan, Alumni dan Kerjasama
Dra. Sari Winahjoe. S, MBA.
Dekan
Prof. Marwan Asri, MBA., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Akademik, Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat
B.M. Purwanto, MBA., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Administrasi, Keuangan dan Pengembangan Sumber Daya Manusia
Eko Suwardi, M.Sc., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan, Alumni, Kerjasama dan Pengembangan Usaha
Wihana Kirana Jaya, M.Soc.Sc., Ph.D.
Dekan
Prof. Dr. Wihana Kirana Jaya, M.Soc.Sc.
Wakil Dekan Bidang Akademik dan Kemahasiswaan
Dr. B.M. Purwanto, M.B.A.
Wakil Dekan Bidang Keuangan, Aset dan Sumber Daya Manusia
Prof. Dr. Slamet Sugiri, M.B.A.
Wakil Dekan Bidang Penelitian, Pengabdian kepada Masyarakat, Kerja Sama dan Alumni
Dr. Muhammad Edhie Purnawan, M.A.
Wakil Dekan Bidang Perencanaan dan Sistem Informasi
Dr. Eko Suwardi, M.Sc.
Dekan
Dr. Eko Suwardi, M.Sc.
Wakil Dekan Bidang Akademik dan Kemahasiswaan
Prof. Mahfud Sholihin, M.Acc., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Keuangan, Aset dan Sumber Daya Manusia
Kusdhianto Setiawan, Sivilekonom., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Penelitian, Pengabdian kepada Masyarakat, Kerja Sama dan Alumni
Amirullah Setya Hardi, Cand.Oecon., Ph.D.
Dekan
Prof. Dr. Didi Achjari, M.Com., Ak., CA.
Wakil Dekan Bidang Akademik dan Kemahasiswaan
Bayu Sutikno, S.E., M.S.M., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Keuangan, Aset, dan Sumber Daya Manusia
Suyanto, S.E., M.B.A., Ph.D.
Wakil Dekan Bidang Penelitian, Pengabdian kepada Masyarakat, Kerja Sama, dan Alumni
Gumilang Aryo Sahadewo, S.E., M.A., Ph.D.
