Fakultas Ekonomika dan Bisnis UGM berafiliasi dan menjadi anggota dari beberapa asosiasi sekolah bisnis dunia.

Nasional

Asosiasi Fakultas Ekonomi dan Bisnis Indonesia (AFEBI).
Dideklarasikan pada tanggal 5 Mei 2006, asosiasi ini merupakan wadah pekumpulan Dekan Fakultas Ekonomi PTN se-Indonesia.
Selengkapnya http://www.afebi.org

Aliansi Program Magister Manajemen Indonesia (APMMI).
Merupakan lembaga yang memberikan pedoman sebagai penyelenggaraan pendidikan terbaik (best practices) dari pendidikan Magister MAnajemen (MM) dalam rangka meningkatan mutu pendidikan MM di Indonesia.
Selengkapnya https://www.apmmi.id

Asosiasi Program Studi S2 Akuntansi Indonesia (APSSAI).
Merupakan asosiasi pengelola program studi S2 yang saat ini beranggotakan Program Studi S2 Akuntansi atau Magister Akuntansi dari universitas-universitas di seluruh Indonesia, dan saat ini berjumlah lebih dari 50 program studi S2 Akuntansi.

Fakultas Ekonomika dan Bisnis UGM dalam memenuhi standar pendidikan dan kualitas pembelajaran telah melakukan akreditasi nasional dan internasional.

Dalam kasus pelanggaran yang serius, FEB UGM dapat meninjau kembali status dan hak sebagai mahasiswa.